服用剂量不当：有些中药含有有毒成分，如附子中含有乌头碱，小剂量使用具有治疗作用，剂量过大或使用不当就会引起中毒;有些中药不含有毒成分，但过量服用也会引起中毒，如过量服用肉桂就会引起血尿。

辨证用药不当：如给肝阳上亢病人服用细辛、肉桂等，等于火上浇油。

来源品种不当：如桑寄生本无毒，但寄生在有毒植物上的桑寄生就会含有相应的有毒成分。

炮制方法不当：有些药材未经炮制或炮制不当会引起有害反应，如经过炮制后的法半夏没有什么毒性，但生半夏却是有毒的。

中药煎煮不当：一般认为煎煮时间不足可能会引起毒性反应。

误服误用：这种情况十分危险，如把香加皮当作五加皮使用，就会发生洋地黄样中毒。

中药品质不好：受到污染或变质的中药会引起有害反应。中药注射剂质量不好，当中含有有害物质、杂质、植物蛋白等，可以引起有害反应。此外，中药假冒伪劣品种可直接导致有害反应。

用药途径不当：如作为肌肉注射用的中药注射液被用于静脉注射，就很容易发生有害反应。

用药时间过长：有些中药用药时间过长也不好，如黄花夹竹桃含有强心苷，长期使用会发生洋地黄样蓄积中毒反应。

配伍不当：有些中药相互间可产生化学反应，如果配伍不当将引起有害反应，如藜芦间也有配伍禁忌，如山楂、五味子、乌梅等与磺胺同时使用就会引起血尿。

忽视个体差异：年龄、性别与体质差异也会引起有害反应，如妇女哺乳期就对许多药物反应敏感。

外用药使用不当：外用制剂辅料，如白酒、酒精、醋等使用不当也会引起有害反应。